결정은 때때로 청색을 띠기도 한다. 25 ℃에서 100 g의 물에 44 g이 녹으며, 알코올에는 녹지 않는다. 강열(强熱)하 면 삼산화몰리브덴으로 변한다. 이 염의 진한 질산용액에 인산 또는 비산(砒酸)의 용액을 첨가하면 포스포몰리브덴산암모늄 ·인비산암모늄의 어느 것에나 황색의 결정성 침전이 생기는데, 이 반응은 인산염 ·규산염의 분석에 사용된다. 또, 인산염 ·규산염에 작용시켜서 포스포몰리브덴산 ·규(硅)몰리브덴산 등의 헤테로다중산을 만들고, 이것을 적당한 조건으로 환원시켜 몰리브덴블루를 생성시켜 비색분석(比色分析)하는 방법에도 널리 사용된다.